Deep Expansion contiene dos módulos que añaden nuevas reglas y mayor profundidad al juego base Alone: el módulo de Criaturas Especiales y el módulo de Acciones Especiales para Salas. Estos módulos pueden jugarse juntos o por separado, y también pueden combinarse con módulos de otras expansiones.
La expansión también contiene nuevas Misiones y nuevos Héroes,que pueden usarse en combinación con el juego base Alone.